Вирус Зика, передающийся комарами был открыт в 1947 году и в течение следующих семи десятилетий практически не повлиял на системы общественного здравоохранения во всем мире.

Только 14 случаев заболевания людей были зарегистрированы в странах Азии и Африки . В 2007 году вирус Зика был впервые обнаружен за пределами Азии и Африки, что вызвало первую зарегистрированную крупную вспышку . Штат Яп, расположенный в Федеративных Штатах Микронезии оценил, что более 72% его жителей старше 3 лет были инфицированы этим вирусом. Причину, вызвавшую эту эпидемию, еще предстоит выяснить, но была выдвинута гипотеза, что его мог заразить человек с веримией, приехавший из Филиппин.

В октябре 2013 г. Вирус Зика достиг Полинезии на юге Тихого океана, и до апреля 2014 г. было инфицировано 30 000 человек, что стало самой крупной вспышкой в то время. Сообщалось о тяжелых неврологических проявлениях этой болезни. Во время и после этой вспышки вирус Зика быстро распространился на другие острова Тихого океана. Органы здравоохранения Новой Каледонии объявили о вспышке вируса в феврале 2014 г., и к концу августа было зарегистрировано 1400 случаев заболевания . Небольшая вспышка была подтверждена на Островах Кука в марте 2014 г., и было зарегистрировано только 905 случаев. Местные органы здравоохранения сообщили о первом аутохтонном случае инфекции в Чили 28 января 2014 года после подтверждения подозреваемого случая на острове Пасхи. К концу вспышки было подтверждено 50 случаев заболевания вирусом Зика в Чили.

В марте 2015 г. исследователи из Федерального университета штата Баия в Бразилии подтвердили присутствие вируса в Бразилии. Были протестированы образцы сыворотки от 24 пациентов из Камасари, Баия, Бразилия, и у семи из них был поставлен положительный диагноз. Позже была подтверждена автохтонная передача вируса в Бразилии, и к декабрю 2015 г. штаты всех регионов страны уже сообщили об автохтонной передаче вируса. Подсчитано, что к концу 2015 года количество случаев заражения вирусом колебалось от 440 000 до 1 300 000. Первоначально были выдвинуты две гипотезы относительно появления недуга в Бразилии, первая из которых предполагала, что вирус был занесен во время чемпионата мира по футболу, проведенного в Бразилии в 2014 году. Другой гипотезой было занесение вируса во время чемпионата по каноэ, проводимого в Рио-де-Жанейро в 2014 году, от спортсмена одной из участвующих тихоокеанских стран. Недавно выдвинули третью гипотезу о появлении вируса в Северной и Южной Америке, предполагающую распространение вируса во время футбольного турнира Кубка Конфедераций 2013 года, который произошел с 15 по 30 июня 2013 года. Первые случаи распространения вируса Зика, вероятно, первоначально были незамеченными, поскольку клинические проявления вируса многие путают с вирусами денге и чикунгунья, которые уже являются эндемичными для Бразилии. Страна выявила 120 161 вероятных случаев и 39 993 подтверждений в 2016 г. В результате всего вышесказанного 1 февраля 2016 г. ВОЗ объявила эту эпидемию в Бразилии чрезвычайной ситуацией в области общественного здравоохранения, имеющей международное значение.

Согласно обновленным эпидемиологическим данным Панамериканской организации здравоохранения от 2 июня 2016 г., с 2015 г. в 39 странах и территориях Американского региона была подтверждена местная трансмиссивная передача вируса Зика.

Сообщалось о ряде завезенных случаев инфекции от путешественников из Европы, Америки, Азии и тихоокеанских стран, возвращавшихся из эндемичных районов, где продолжалась эпидемия этого вируса. Завоз заболевших в районы, где обитают комары, создает риск массового распространения вируса во всем мире.